五官医院眼科始建于1980年，为市级重点专科，黑龙江省青少年近视防控基地，齐齐哈尔市准分子激光近视治疗中心。2008年五官医院并入第一医院，进行集团化管理，本着将眼科做大做强的理念，2016年组建齐齐哈尔市眼科医院。开设了斜视弱视门诊、泪器疾病门诊、准分子激光门诊、角膜病门诊、眼底病门诊、验光配镜中心。开展玻璃体黄斑牵拉综合征手术治疗、特发性黄斑前膜手术治疗、抗VEGF药物玻璃体腔注射治疗老年黄斑变性等多项新技术，目前开展的微创玻璃体手术治疗玻璃体积血、黄斑前膜、视网膜脱离技术等。